蝎子不像一般的经济动物如毛皮动物那样容易发生传染病，也不会像其他畜禽那样发生传染病造成大批死亡。但是，如果蝎房内卫生条件不好，温度过高或过低，食料和饮水不卫生，也会导致疾病。蝎子的有些疾病往往难以治好，所以必须以预防为主。
　　蝎子养殖场的卫生防疫主要包括蝎场及蝎房食物卫生、环境卫生、蝎房及蝎垛消毒等三个方面。
　　1、环境卫生蝎子对温度、湿度有一定要求，尤其是蝎房空气湿度及饲养土湿度的保持，对防病是十分重要的。要求将饲养土湿度保持在15%-18%。空气湿度一般情况下不超过80%，但也不能过于，土壤水分不能低于5%。
　　对于蝎子养殖蝎房内大量堆放的粪便、食物残屑，以及死亡的蝎子，都应立即清扫，不留污物，以免饲养室内细菌滋生，引起蝎子的疾病发生。
　　2、食物卫生这里所说的食物卫生，是指饲料和饮水卫生。由于蝎子的饲料来自人工培养的小型动物，饲料卫生需要从饲料动物培育时就抓紧、抓好。绝对不能投喂变质的、腐败的食物，以免引发传染性疾病发生。饮水要卫生，不能饮放置多日的“死水”或污水，这样的水蝎子饮后易发病。
　　3、防疫消毒养蝎与饲养其他动物一样，对疾病要防重于治。只要防疫性消毒工作严格，疾病发生率就低，而蝎子的成活率就高，可以给养蝎减少很多麻烦。
　　消毒工作可分四种情况：
　　1、环境消毒养竭场区定时清除杂草、清除垃圾，环境打扫完毕后，用0.02%-0.04%的福尔马林进行喷洒消毒，以减少环境中的病原微生物的发生。
　　2、室内消毒新设的养蝎室清扫以后，或老的养蝎室在蝎子成批转室后进行彻底打扫，打扫以后的室内必须经过消毒。消毒的方法是用5%的来苏儿溶液彻底喷洒消毒，或用熏蒸方法消毒。熏蒸方法消毒适宜于室内空间不大的情况下。即按l米3空间14克高锰酸钾、28毫升福尔马林的量，在房间中间放一个陶瓷容器，按空间称取的高锰酸钾放在陶瓷容器内，把按空间量取的福尔马林倒在高锰酸钾上，关闭好门窗。待熏蒸消毒后气味散尽方可再放新的蝎群。
　　3、发现病蝎后的处理消毒如果在室内发现了病蝎，特别是发现了发霉现象的死蝎后，应立即清理室内的活蝎，将活的健康蝎转移到其他养竭室，然后立即清除污物和陈旧饲养土，并对室内和垛体进行消毒。室内消毒可以用5%来苏儿喷洒，也可以用0.O2%-O.04%的福尔马林溶液喷洒。对垛体可以用柴草烧的方法达到彻底消毒的目的。
　　4、蝎子养殖设施及工具消毒饲养室内的设备和工具，因养蝎温度和 湿度适宜，可能会有病原微生物附着后滋生，凡是可以搬动的，都必须定期搬出养蝎室消毒灭菌后再重新使用。这些工具消毒方法有以下几种：大型工具或设施可用5%来苏儿或1%的福尔马林喷洒消毒。养蝎的器血可用0.1%高锰酸钾浸泡消毒。